Agarosa
La agarosa es un polisacárido formado por uniones de β-D-galactopiranosa con 3,6-anhidro-α-L-galactopiranosa mediante enlaces 1-4. Esta unidad básica de repetición, llamada agarobiosa, forma largas cadenas. Esta estructura contiene grupos cargados, como sulfato y piruvato, y grupos sin carga, y todos ellos son responsables de muchas de las propiedades de la agarosa. Estas propiedades se pueden ajustar para satisfacer necesidades específicas mediante una selección cuidadosa de la materia prima.
Algunas propiedades importantes de la agarosa son:
Fuerza del gel: es la fuerza necesaria para romper un gel, expresada en g/cm2. Temperatura de gelificación: es la temperatura a la cual una solución de agarosa forma un gel rígido
. Temperatura de fusión: es la temperatura a la cual el gel pasa a ser una disolución. EEO (electroendosmosis): es una medida del número de grupos cargados presentes en la agarosa.
La agarosa estándar es ideal para la separación rutinaria rápida de fragmentos de ADN y ARN, así como para productos de PCR, la preparación de plásmidos y para las técnicas de detección, clonación y transferencia.
Se trata de una agarosa altamente purificada, con valores bajos de electroendósmosis que oscilan entre 0.05 y 0.13. Apta para ensayos de Blotting. No se detecta la presencia de DNAsas y RNAsas. Disponible con certificado de control de calidad GQT (Genetic Quality Tested). Está especialmente recomendada para geles preparativos de ADN.
Biomax es una agarosa ideal para la rápida separación rutinaria de fragmentos de ADN y ARN, así como para productos de la PCR, la preparación de plásmidos y para la detección, la clonación y técnicas de transferencia.
Agarosa con mayor temperatura de gelificación que las agarosas D1, proporcionando mayor estabilidad térmica a los geles. Tiene baja electroendósmosis (≤ 0.14). Sus principales aplicaciones son la electroforesis de ácidos nucleicos, la electroforesis de proteínas y la preparación de perlas de agarosa. Existen variantes de baja viscosidad para resinas de concentraciones muy elevadas
Se trata de un polímero lineal con un peso molecular muy alto, por lo que, a diferencia de las agarosas tradicionales, da estructuras de gel. Esta característica, sumada a un muy bajo contenido de sulfato, produce una fuerte interacción intercatenaria, lo que genera un gel con una resistencia de gel muy alta y un alto límite de exclusión.
Las agarosas de bajo punto de fusión (LM) se obtienen por modificación de su estructura química natural original. Las propiedades principales de estas agarosas son sus bajas temperaturas de fusión y gelificación, en comparación con las agarosas estándar.
La baja temperatura de fusión permite la recuperación de ácidos nucleicos intactos y biológicamente activos, no dañados por la temperatura por debajo de la temperatura de desnaturalización. La baja temperatura de gelificación asegura que la agarosa estará en un estado líquido en un rango de temperatura en el que se puedan realizar manipulaciones In-Gel sin previa extracción del ADN del gel.
Características:
- Menor fuerza de gel que las agarosas estándar. Aun así, los geles se pueden manejar fácilmente.
- Temperaturas de gelificación/fusión más bajas que las de la agarosa estándar.
- Mayor claridad (transparencia del gel) que los geles preparados con agarosa estándar.
- Mayor capacidad de cribado.
LM
Agarosa Low Melt (con bajo punto de fusión) recomendada para la separación de fragmentos ≥ 1 000 pb en electroforesis analítica. La baja temperatura de fusión (65 ºC) permite fundir la agarosa sin dañar la doble hélice de ADN. No se detecta la presencia de DNAsas y RNAsas. Disponibles versiones SLM y ELM con punto de fusion incluso mas bajos y con certificado de control de calidad GQT (Genetic Quality Tested)
LMSI
Temperatura de fusión muy baja y con una alta capacidad resolución para fragmentos ≤ 1 000 pb, especial para productos PCR, entre 200 y 800 pb con certificado de control de calidad GQT (Genetic Quality Tested). No se detecta la presencia de DNAsas y RNAsas.
NUGQ
Bajas temperaturas de fusión y gelificación que además posee el certificado GQT (Genetic Quality Tested). Esta agarosa, con alta capacidad de resolución, separa fragmentos de entre 50 y 1 000 pb, especialmente en los productos PCR. No se detecta la presencia de DNAsas y RNAsas.
Estas agarosas han sido modificadas químicamente para obtener una estructura que mejore la separación de pequeños fragmentos de ADN y la resolución entre fragmentos de tamaño muy similar.
Características:
- Alta capacidad de resolución, en algunos casos cercana a la obtenida con geles de poliacrilamida.
- Geles muy claros y transparentes, incluso a altas concentraciones.
- 4% que proporciona una excelente separación para los tamaños de fragmentos más pequeños.
MS04
La agarosa con capacidad de tamizado molecular mas alta; capaz de separar fragmentos de tamaño muy pequeño con diferencias de pocos pares de bases. Sus temperaturas de gelificación / fusión se encuentran en el rango de las agarosas Low Melt. Su baja viscosidad permite preparar geles de alta concentración y, por lo tanto, aumentar su capacidad de tamizado.
MS06
Presenta una eficacia resolutiva mejorada para pequeños fragmentos de ADN (10-1.200 pb) y productos PCR. No se detecta la presencia de DNAsas y RNAsas, y presenta DNA Binding muy bajo.
MS08
Producto recomendado para geles analíticos de ADN ≤ 1.200 pb y especialmente productos PCR. No se detecta la presencia de DNAsas y RNAsas y no presenta DNA Binding.
MS12
Aconsejada para geles analíticos de ADN. A una concentración del 2 % es capaz de separar fragmentos 30-1.500 pb. No se detecta la presencia de DNAsas y RNAsas y no presenta DNA Binding.